在研科研项目

• 国家自然科学基金：副溶血弧菌超级核酸酶VPA1360操控宿主胞质DNA感应信号通路，2023.1-2026.12，项目主持人

• 浙江省自然科学基金：铜绿假单胞菌Ser/Thr蛋白激酶Stk1介导AlgR磷酸化调控毒力与耐药，2022.1-2024.12，项目主持人

• 横向：高深度微生物蛋白酪氨酸磷酸化组学技术开发，项目主持人

已结题教学及科研项目（部分）

• 国家自然科学基金：副溶血弧菌T3SS2效应蛋白VPA1324操控宿主cdG免疫信号通路的肠毒性机制，项目主持人

• 浙江省自然科学基金面上项目：铜绿假单胞菌PpkA磷酸化网络及其对耐药的调控机制研究，项目主持人

• 国家自然科学基金：副溶血弧菌VP0057介导蛋白质磷酸化修饰调控毒力的分子机制

• 国家自然科学基金：铁离子调控大肠埃希菌O157:H7外膜孔蛋白OmpW 抗先天免疫的分子机制，项目主持人

• 浙江省科技厅公益技术项目：铁离子介导病原菌毒力蛋白OmpW抗先天性免疫，项目主持人

• 浙江省自然科学基金：铁离子介导细菌外膜OmpW蛋白复合物抗先天性免疫研究，项目主持人

• 浙江省自然科学基金项目：沙瑞度坦抑制人粒性白血病细胞增殖的靶点蛋白筛选及其功能研究，参与（排名2/5）

• 国家自然科学基金：金属富勒烯的质谱研究，参与（排名2）

• 浙江省自然科学基金项目：iTRAQ技术结合LC-MS分析RegⅣ诱导大肠癌细胞系迁移机制的研究，参与（排名2）

• 浙江省教育厅科技项目：凡纳对虾血蓝蛋白的多聚体结构与免疫活性关系研究，项目主持人

• 浙江省高校生物学重中之重（一级）学科优秀青年基金：大肠埃希菌外膜蛋白OmpW抗氧化应激的分子机制及铁离子的调控作用，项目主持人

• 浙江理工大学科研项目：铁在细菌感染发病机制中介导菌外膜蛋白OmpW与吞噬细胞的相互作用研究，项目主持人

• 浙江理工大学教育教学改革重点项目：“新工科”理念下海洋资源开发技术专业课程体系的研究与实践，项目主持人

• 浙江理工大学教改项目：生物化学在线开放课程，项目主持人

• 浙江理工大学新专业建设项目：海洋资源开发技术专业，项目主持人

• 浙江理工大学教改项目：《生物化学》精品网络课程建设项目，项目主持人

近年来通讯作者论文（* 通讯作者）

• Zhu X, Feng C, Zhou L, Li Z, Zhang Y, Pan J*. (2021) Impacts of Ser/Thr Protein Kinase Stk1 on the Proteome, Twitching Motility, and Competitive Advantage in Pseudomonas aeruginosa. Front Microbiol, 2021, 12:738690. (IF: 5.64)

• Ye C, Ge Y, Zhang Y, Zhou L, Chen W, Zhu X, Pan J*. Deletion of vp0057, a Gene Encoding a Ser/Thr Protein Kinase, Impacts the Proteome and Promotes Iron Uptake and Competitive Advantage in Vibrio parahaemolyticus. J Proteome Res. 2021, 20(1):250-260. (IF: 4.466)

• Zhou L, Zhang Y, Ge Y, Zhu X, Pan J*. Regulatory Mechanisms and Promising Applications of Quorum Sensing-Inhibiting Agents in Control of Bacterial Biofilm Formation. Front Microbiol. 2020, 11:589640. (IF: 4.235)

• Gao Z, Ye C, Zhou L, Zhang Y, Ge Y, Chen W, Pan J*. Evaluation of the β-barrel outer membrane protein VP1243 as a candidate antigen for a cross-protective vaccine against Vibrio infections. Microb pathogenesis. 2020, 147:104419. (IF: 3.738)

• Li B, Guo F, Hu H, Liu P, Tan M, Pan J*, Zhai L*. The characterization of column heating effect in nano-flow liquid chromatography mass spectrometry (nanoLC-MS)-based proteomics. Journal of Mass Spectrometry. 2020, 55(1): e4441. (IF: 2.267)

• Zhang P, Ye Z, Ye C, Zou H, Gao Z, Pan J*. OmpW is positively regulated by iron via Fur, and negatively regulated by SoxS contribution to oxidative stress resistance in Escherichia coli. Microb Pathogenesis. 2020, 138:103808. (IF: 3.738)

• Jianyi Pan*, Zhenzhong Zha, Pengfei Zhang, Ran Chen, Chen Ye, Ting Ye. Serine/threonine protein kinase PpkA contributes to the adaptation and virulence in Pseudomonas aeruginosa. Microbial Pathogenesis, 2017, 113: 5-10. (IF: 2.332)

• 李楚楚，李伟燕，潘建义*. 副溶血弧菌Ⅲ型分泌系统(T3SS)效应蛋白及其对宿主细胞的操控. 中国生物化学与分子生物学报，2017, 33(3): 247-251.

• Zha Z, Li C, Li W, Ye Z, Pan J*. LptD is a promising vaccine antigen and potential immunotherapeutic target for protection against Vibrio species infection. Scientific Reports. 2016, 6: 38577. (IF: 5.228)

• Li W, Wen L, Li C, Chen R, Ye Z, Zhao J, Pan J*. Contribution of the outer membrane protein OmpW in Escherichia coli to complement resistance from binding to factor H. Microbial Pathogenesis. 2016, 98:57-62. (IF: 1.888)

• Pan J*, Li C, Ye Z. Immunoproteomic Approach for Screening Vaccine Candidates from Bacterial Outer Membrane Proteins. Vaccine Design: Methods and Protocols, Volume 2: Vaccines for Veterinary Diseases. Chapter 34, Springer New York, 2016.

• Pan J*, Chen R, Li C, Li W, Ye Z. Global Analysis of Protein Lysine Succinylation Profiles and Their Overlap with Lysine Acetylation in the Marine Bacterium Vibrio parahemolyticus. Journal of Proteome Research. 2015, 14(10):4309-18. (IF: 4.353)

• Wang KZ, Weng LY, Ye ZC, Wu HG, Pan JY*. Hemocyanin-derived phenoloxidase activity is dependent on dodecameric structure in shrimp Litopenaeus vannamei. Archives of Biological Sciences. 2015, 67(1):19−23.

• Pan J*, Ye Z, Cheng Z, Peng X, Wen L, Zhao F. Systematic Analysis of the Lysine Acetylome in Vibrio parahemolyticus. Journal of Proteome Research. 2014, 13(7):3294-3302. (IF: 5.001)

• Li C, Ye Z, Wen L, Chen R, Tian L, Zhao F, Pan J*. Identification of a novel vaccine candidate by immunogenic screening of Vibrio parahaemolyticus outer membrane proteins. Vaccine. 2014, 32(46): 6115–6121. (IF: 3.624)

• 潘建义*, 王长一, 叶智鸧, 陈冉, 赵辅昆. 巨噬细胞应激的铜绿假单胞菌磷酸化蛋白质组分析. 中华微生物学和免疫学杂志, 2014, 34(2): 91-95.

• Wu XB, Tian LH, Zou HJ, Wang CY, Tang CH, Yu ZQ, Zhao FK, Pan JY*. Outer membrane protein OmpW of Escherichia coli is required for resistance to phagocytosis. Research in Microbiology. 2013, 164(8): 848-855. (IF: 2.826)

• 田丽花, 叶智鸧, 温良优, 潘建义*, 赵辅昆. 副溶血弧菌免疫原性蛋白的鉴定及克隆表达. 浙江理工大学学报, 2013, 30(6): 881-886.

• Li H, Pan JY, Liu XJ, Gao JX, Wu HK, Wang C, Peng XX. Alterations of protein complexes and pathways in genetic information flow and response to stimulus contribute to Escherichia coli resistance to balofloxacin. Molecular BioSystems. 2012, 8(9):2303-2311.

• Zhao J, Wen G, Ding M, Pan JY, Yu ML, Zhao F, Weng XL, Du JL. Comparative proteomic analysis of colon cancer cell HCT-15 in response to all-trans retinoic acid treatment. Protein and Peptide Letters. 2012, 19(12):1272-1280.

• Pan JY, Wu H, Liu X, Li PP, Li H, Wang SY, Peng XX. Complexome of Escherichia coli cytosolic proteins under normal native conditions. Molecular BioSystems. 2011, 7(9):2651-2663.

• 吴贤斌, 邹海杰, 田丽花, 潘建义*, 赵辅昆. 大肠杆菌外膜蛋白ompW基因敲除菌的构建及其对两种抗生素的敏感性. 微生物学报, 2012, 52(8):1021- 1026.

• 邹海杰, 吴贤斌, 潘建义*, 赵辅昆. 大肠杆菌外膜蛋白OmpW的克隆及在外膜上高表达. 中国生物工程杂志, 2011, 31(12):46-50.

• 潘建义*, 吴海港, 王浩波. 对虾血蓝蛋白多聚结构与凝集活性. 中国病原生物学杂志, 2011, 6(1): 26-28.

• Pan JY, Li H, Ma Y, Chen P, Zhao P, Wang SY, Peng XX*. Complexome of Escherichia coli envelope proteins under normal physiological conditions. Journal of Proteome Research. 2010, 9(7):3730-3740.

• PAN Jian-Yi *, YU Zhi-Qiang. Isolation and characterization of Hainantoxin-II, a new neurotoxic peptide from the Chinese bird spider (Haplopelma hainanum). Zoological Research, 2010, 12; 31(6): 570−574.

• Pan JY*, Chen P, Wang SY. Modification of energy metabolism-related proteins is responsible for ceftriaxone-resistance. Chin J Biochem Mol Biol, 2010, 26(2): 140-149.

重要会议论文(摘要)

• 李楚楚，查振中，李伟燕，潘建义*.海洋弧菌外膜蛋白LptD: 潜在的疫苗靶位及药物靶点. 第十届全国海洋生物技术与创新药物暨海洋生化学术会议, 2016年8月20-24日，锦州.

• 王长一, 潘建义*, 赵辅昆. 巨噬细胞应激的铜绿假单胞菌磷酸化蛋白质组分析. 第四届全国“跨学科蛋白质研究”学术研讨会（蛋白质与人类健康）， 2013年10月12-14日，合肥.

• Jian-yi Pan, San-Ying Wang, Xuanxian Peng. Cytoplasmic protein complexome involved in ceftriaxone resistance in Escherichia coli. The HUPO2012 11th Annual World Congress conference, September 9-13 in Boston, MA in the United States.

• Jian-Yi Pan, Hui Li, Sanying Wang, Xuanxian Peng. Protein Complexome of Escherichia Coli Cell Envelope Under Proximately Physiological Conditions. 2010 AIChE Annual Meeting: Salt Lake City, UT, USA.

• Xian-bing Wu, Li-hua Tian, Hai-jie Zou, Chang-yi Wang, Zhi-qiang Yu, Chen-hong Tang, Fu-kun Zhao, Jian-yi Pan*. Vaccine candidate outer membrane protein OmpW of Escherichia coli is required for resistance to host innate immunity. 2012年全国生物化学与分子生物学学术大会, 8月24-26, 成都.

发明专利

• 专利申请号：202110305802.3；专利授权日：2022.6.10；发明创造名称：副溶血性弧菌基因缺失弱毒株和重组副溶血性弧菌减毒活疫苗及其制备方法和应用；发明人：潘建义，高智超，查振中，查银河.

• 专利号：201210275708.9；专利授权日：2015年7月22日；申请人：浙江理工大学；发明名称：一种以大肠杆菌外膜孔蛋白ompW为靶点筛选药物的方法；发明人：潘建义，吴贤斌，邹海杰.

• 专利申请号：201711005989.5；专利申请日：2017.10.25；申请人：浙江理工大学；发明创造名称：外膜蛋白VP1243在防治弧菌感染中的应用；发明人：潘建义，查振中; 李守梁; 李伟燕; 蔡兴浩.

• 专利申请号：201410475962.2；专利申请日：2014年09月17日；申请人：浙江理工大学；发明创造名称：一种副溶血弧菌外膜蛋白LptD的制备方法及其应用；发明人：潘建义，李楚楚，叶智鸧，温良优，陈冉，田丽花.