微生物制剂的开发。2001在浙江大学微生物研究所从事微生物钾肥研究和开发，在浙江省科技计划项目的支持下，获得专利1项和临时登记许可证，该产品在水稻、蔬菜、芋头、半夏等多种经济作物生产中应用效果显著。2006年在国家863科技计划项目支持下，开展设施农业土壤障碍的微生物调控关键技术研究，综合运用新技术育种、高通量筛选、芯片检测及高密度发酵等新技术，获得2个高效菌株，对设施农业土壤障碍的微生态调控显示较好的结果，获得授权专利2项。

特色药用植物的研究。2008在重中之重开放基金的支持下，进行了特色药用植物——半夏病害与生防研究，首次确定了半夏软腐病的病原，获得了具有较强预防半夏软腐病及其它多张病害的生防菌，发表论文5篇；2012年在省自然基金的支持下，进行铁皮石斛内生细菌与铁皮石斛生长和品质的相关性研究，创造性地发现内生细菌在刺激铁皮石斛生长激素的分泌、固氮、促进药效成分积累等方面具有显著作用，为推动人工栽培铁皮石斛的经济效益带来了曙光，目前该方面工作已获得2个专利，发表SCI论文3篇。

微生态与基因组研究。2010.12-2012.03在佛罗里达大学访学期间，主要进行柑橘枯萎病发病机制及其与微生物生态学相关性研究。完成了新基因（osrX, XAC3049）的功能研究，发现该基因主要通过影响多胺类的合成，降低oxyR基因的表达，进而影响解毒基因（过氧化氢酶、谷胱甘肽还原酶）的表达，导致该菌的抗氧化能力显著降低，从而丧失致病性；探索了感病植株的微生态变迁，发表2篇论文。完成了微生物钾肥生产菌株胶质类芽孢杆菌KNP414的基因组测序和表达谱分析，发现该菌存在固氮、固碳与生物吸附等功能及其相关基因，为其应用开发提供了理论依据。以铁皮石斛为对象，建立了微生物生态的研究方法，确定了土壤和生物样品的总基因组DNA提取、DGGE植物图谱分析等方法，并已申请专利。